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| Data de publicação | Data de defesa | Título | Autor(es) | Orientador(es) | Coorientador(es) |
| 24-nov-2025 | 11-mar-2025 | Adaptive patch grid strategy for parallel protein folding using atomic burials with NAMD | Macedo, Emerson de Araujo | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 15-mai-2016 | 9-set-2015 | Algoritmos paralelos exatos e otimizações para alinhamento de sequências biológicas longas em plataformas de alto desempenho | Sandes, Edans Flávius de Oliveira | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 10-abr-2018 | 19-dez-2017 | Alinhamento primário e secundário de sequências biológicas em arquiteturas de alto desempenho | Lima, Daniel Sundfeld | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 2006 | 2006 | Alocação de tarefas paralelas comunicantes em ambientes distribuídos heterogêneos | Santana, Marcelo Nardelli Pinto | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| mai-2008 | mai-2008 | Arquiteturas em FPGA para comparação de sequências biológicas em espaço linear | Corrêa, Jan Mendonça | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 26-jul-2021 | 5-mar-2021 | Comparação paralela de sequências biológicas em múltiplas GPUs com descarte de blocos e estratégias de distribuição de carga | Figueirêdo Júnior, Marco Antônio Caldas de | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 24-nov-2025 | 13-mar-2025 | Comparação paralela de sequências biológicas em múltiplas GPUs com mecanismo de tolerância a falhas | Soares, Filipe Maia | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 5-jan-2023 | 19-abr-2022 | Comparação paralela de sequências biológicas em plataformas de hardware uniformes e híbridas | Jorge, Carlos Antônio Campos | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 27-fev-2012 | 30-jun-2011 | Comparação paralela de sequências biológicas longas utilizando Unidades de Processamento Gráfico (GPUs) | Sandes, Edans Flávius de Oliveira | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 26-abr-2013 | 31-jan-2013 | Comparação paralela exata de sequências biológicas em plataformas híbridas de alto desempenho | Mendonça, Fernando Machado | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 16-nov-2009 | 20-mar-2006 | Comparação paralela exata de seqüências biológicas longas com uso limitado de memória | Batista, Rodolfo Bezerra | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 9-abr-2020 | 20-ago-2019 | CUDA-Parttree : estratégia paralela em GPU para alinhamento múltiplo heurístico de milhares de sequências | Razzolini, Cainã Felipe Bento | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 19-jan-2011 | 25-out-2010 | Estratégia distribuída híbrida em cluster multicore heterogêneo para alinhamento múltiplo de sequencias biológicas com o dialign-tx | Macedo, Emerson de Araújo | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | Pfischer, Gerson Henrique |
| 20-mai-2013 | 28-ago-2012 | Estratégia paralela exata para o alinhamento múlltiplo de sequências biológicas utilizando Unidades de Processamento Gráfico (GPU) | Lima, Daniel Sundfeld | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 2009 | 2009 | Estratégia paralela para alinhamento múltiplo de sequências com algoritmo genético multi-ilha | Miranda, Lídia Araujo | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de; Correa, Jan Mendonça | - |
| 16-mai-2016 | 22-mar-2016 | Fickett-CUDAlign : comparação paralela de sequências biológicas com estratégia multi-bloco de faixas ajustáveis | Silva, Gabriel Heleno Gonçalves da | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 17-mar-2025 | 8-out-2024 | A framework for automated parallel execution of scientific multi-workflow applications in the cloud with work stealing | Silva, Helena Schubert da Incarnação Lima da | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 5-abr-2011 | 24-jun-2010 | Framework P2P para execução de tarefas bag-of-tasks com múltiplas políticas de alocação em ambientes distribuídos heterogêneos | Leite, Alessandro Ferreira | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 21-jun-2011 | 14-out-2010 | Framework para execução adaptativa e tolerante a falhas de workflows em grid | Guimarães, Felipe Pontes | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 17-set-2007 | 17-set-2007 | GrAMoS : serviço para a monitoração de acordos em Grid | Scorsatto, Glauber | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |