| Data de publicação | Data de defesa | Título | Autor(es) | Orientador(es) | Coorientador(es) | 
| 15-dez-2006 | 15-dez-2006 | Análise da coordenação da cadeia agroindustrial orientada pela qualidade : o caso Illy café | Ximenes, Filipe Tiago Dias | Botelho Filho, Flávio Borges | - | 
| 7-abr-2016 | 9-mar-2015 | Análise da relação contratual entre produtor integrado e agroindústria na produção de frango do Distrito Federal sob os preceitos da teoria da agência | Lima, Priscilla Ferreira de | Botelho Filho, Flávio Borges | Silva, Itiberê Saldanha | 
| 28-mai-2016 | 25-fev-2016 | Avaliação do mercado futuro do milho brasileiro como mecanismo de apoio à comercialização para os produtores de Goiás | Silva, Felipe Morelli da | Botelho Filho, Flávio Borges | Silva, Itiberê Saldanha | 
| 22-jan-2014 | set-2013 | Caracterização e análise das certificações (conformidade) de unidades de produção orgânica no Distrito Federal | Almeida, Fernando Cleser Moreno de | Botelho Filho, Flávio Borges | Soares, João Paulo Guimarães | 
| 7-mai-2011 | 26-fev-2009 | A contribuição do fundo constitucional de financiamento do centro-oeste para o agronegócio do estado de Goiás | Santos, Antonio Henrique Pereira dos | Botelho Filho, Flávio Borges | - | 
| 29-jul-2016 | 29-abr-2016 | Cooperativismo, agroindústria da agricultura familiar e mercado : um estudo de caso da COOPERCUC/BA | Martins, Matteus Guimarães | Botelho Filho, Flávio Borges | - | 
| 5-abr-2011 | 11-fev-2010 | A desconfiança dos cafeicultores da zona da mata mineira no gerenciamento de cooperativas agrícolas : subsídios para a nova economia institucional | Masson, Thiago Siqueira | Botelho Filho, Flávio Borges | - | 
| 5-jun-2008 | 5-jun-2008 | Efeitos da produção de etanol e biodiesel na produção agropecuária do Brasil | Hernández, Dora Isabel Murillo | Botelho Filho, Flávio Borges | - | 
| 14-mai-2015 | 6-mar-2015 | Estratégias de comercialização : o caso dos agricultores familiares do Assentamento Rio Paraíso – Município de Jataí (GO) | Sieb, Décio Lauri | Botelho Filho, Flávio Borges | - | 
| 2009 | 2009 | Estudo comparado dos custos de transação da comercialização antecipada e do mercado de futuros de soja | Silva, Ronaldo dos Santos | Botelho Filho, Flávio Borges | - | 
| 10-dez-2013 | 7-ago-2013 | A expansão do setor sucroenergético goiano no século XXI : evolução e perspectivas futuras | Silva, Evandro de Souza | Botelho Filho, Flávio Borges | - | 
| 26-out-2018 | 21-mai-2018 | Gestão do crédito pelos órgãos de governança sob enfoque da transparência : estudo de caso de uma cooperativa de crédito | Franco, Douglas Sampaio | Botelho Filho, Flávio Borges | - | 
| 3-ago-2015 | 2-mar-2015 | Impacto social do Programa Nacional de Produção e Uso de Biodiesel (PNPB) no nordeste : 2008/2013 | Pires, Vívian Beatriz Lopes | Botelho Filho, Flávio Borges | Lourenço, Luiz Carlos de Brito | 
| 4-ago-2008 | 4-ago-2008 | Mercado institucional de alimentos : potencialidades e limites para a agricultura familiar | Maciel, Lucas Ramalho | Botelho Filho, Flávio Borges | - | 
| 2-jul-2013 | 22-fev-2013 | O frigorífico como prestador de serviço : estudo de caso | Botelho, Fernando Carlos Evangelista | Botelho Filho, Flávio Borges | Silva, Itiberê Saldanha | 
| 16-out-2009 | dez-2007 | Organismos geneticamente modificados (OGMs) : obstáculos à obtenção e uso no Brasil | Cunha, Elza Angela Battaggia Brito da | Botelho Filho, Flávio Borges | - | 
| 16-ago-2018 | 28-fev-2018 | Práticas normativas e plasticidade de mercado : a construção de uma dose de cachaça | Thomé, Kahlil Marini | Botelho Filho, Flávio Borges | - | 
| 22-nov-2013 | 19-ago-2013 | Sistemas Agroflorestais para Agricultura Familiar : análise econômica | Moura, Maurício Rigon Hoffmann | Botelho Filho, Flávio Borges | Diniz, Janaína Deane de Abreu Sá |