| Date de publication | Data de defesa | Titre | Auteur(s) | Orientador(es) | Coorientador(es): | 
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| 26-jui-2012 | 22-mar-2012 | Análise informacional dos enterramentos atômicos em proteínas globulares | Rocha, Juliana Ribeiro | Araújo, Antônio Francisco Pereira de | - | 
| 27-sep-2019 | 20-mar-2019 | Enterramentos atômicos como possíveis intermediários informacionais no código do enovelamento proteico | Ferreira, Diogo César | Araújo, Antônio Francisco Pereira de | - | 
| 17-avr-2011 | 24-fév-2010 | Investigação das interações moleculares da proteína citoplasmática ligante à cauda poli(A) : associação PABPC-PABPC | Camargo, Ricardo | Araújo, Antônio Francisco Pereira de | Sá, Cezar Martins de | 
| 25-avr-2014 | 28-nov-2013 | Simulação do enovelamento de proteínas com potenciais de enterramentos atômicos dependentes da sequência | Van der Linden, Marx Gomes | Araújo, Antônio Francisco Pereira de | - |