| Data de publicação | Data de defesa | Título | Autor(es) | Orientador(es) | Coorientador(es) | 
| 27-dez-2019 | 3-jun-2019 | Análise do impacto na compreensão de programas Java com a introdução de expressões lambda | Mendonça, Walter Lucas Monteiro de | Almeida, Rodrigo Bonifácio de | - | 
| 9-nov-2021 | 21-mai-2021 | Applying fine-grained co-change dependencies to identify refactoring opportunities | Oliveira, Marcos César de | Almeida, Rodrigo Bonifácio de | - | 
| 11-mar-2020 | 5-ago-2019 | Automatically fixing static analysis tools violations | Marcilio, Diego Venâncio | Almeida, Rodrigo Bonifácio de | - | 
| 1-fev-2019 | 13-jul-2018 | Uma caracterização da adoção de DevOps utilizando Grounded Theory | Luz, Welder Pinheiro | Almeida, Rodrigo Bonifácio de | - | 
| 6-jan-2017 | 11-jul-2016 | Contratos REST robustos e leves : uma abordagem em design-by-contract com NeoIDL | Lima, Lucas Ferreira de | Almeida, Rodrigo Bonifácio de | - | 
| 13-ago-2024 | 7-jul-2023 | DogeFuzz : um framework extensível para estudos de fuzzing na análise dinâmica de Smart Contracts | Medeiros, Ismael Coelho | Almeida, Rodrigo Bonifácio de | - | 
| 1-mai-2021 | 10-dez-2020 | Explorando o uso de análise estática e aprendizagem supervisionada de máquina para a identificação de códigos maliciosos em arquivos executáveis do sistema operacional Microsoft Windows | Ribeiro, Alexandre José | Almeida, Rodrigo Bonifácio de | - | 
| 14-fev-2017 | 3-set-2015 | Exploring the use of co-change clusters in software comprehension tasks | Oliveira, Marcos César de | Almeida, Rodrigo Bonifácio de | Ramos, Guilherme Novaes | 
| 12-jun-2020 | 2-out-2019 | Extração e evolução de linhas de produtos de software usando Delta-Oriented Programming : um relato de experiência | Souza, Leomar Camargo de | Almeida, Rodrigo Bonifácio de | - | 
| 1-dez-2017 | 4-ago-2017 | Percepções de práticas ágeis em desenvolvimento de software : benefícios e desafios | Mazuco, Alan Saulo da Costa | Almeida, Rodrigo Bonifácio de | - | 
| 4-nov-2022 | 24-jun-2022 | RVSec : Runtime verification methods for high precision detection of cryptography API misuse | Torres, Adriano Rodrigues Figueiredo | Almeida, Rodrigo Bonifácio de | - | 
| 27-ago-2018 | 29-set-2017 | Transformações de programa para suportar a evolução da linguagem Java | Dantas, Reno Medeiros | Almeida, Rodrigo Bonifácio de | - | 
| 2-dez-2014 | 14-jul-2014 | Um protocolo de autenticação e autorização seguro para arquiteturas orientadas a serviços | Conceição, Rogério Alves da | Almeida, Rodrigo Bonifácio de | - | 
| 26-jan-2017 | 28-jun-2016 | Uma abordagem orientada a serviços para a modernização de sistemas legados | Agilar, Everton de Vargas | Almeida, Rodrigo Bonifácio de | - | 
| - | 18-fev-2020 | What could the source code history tell UsAbout  errors | Amaral, Luis Henrique Vieira | Almeida, Rodrigo Bonifácio de | - |