Diversidade de vírus de genoma de RNA em maracujazeiros do Brasil

Abstract

O maracujá é uma planta tropical (gênero Passiflora, família Passifloraceae) cultivada em diversas regiões do mundo. Atualmente o Brasil é destaque por ser o maior produtor do fruto, por ter um dos maiores centros de origem e de diversidade de espécies, bem como, abrigar um dos maiores bancos de germoplasma de Passiflora destinados a conservação e preservação da espécie, e o uso dos recursos genéticos que destas plantas dispõe em programas de melhoramento genético. Diversos sintomas de etiologia viral têm sido relatados na cultura no país, entretanto estudos sobre esses vírus ainda são escassos. Em etapas anteriores deste trabalho, foram identificados vírus ainda não descritos infectando maracujazeiros nos estados do Mato Grosso do Sul e Bahia. A fim de expandir ainda mais o conhecimento sobre a diversidade viral nesta importante cultura, este estudo objetivou investigar a diversidade de vírus em espécies de Passiflora do Brasil e caracterizar novos vírus identificados. Para isso, diversos maracujazeiros cultivados em campos comerciais foram amostrados em várias regiões do país, bem como, acessos de Passiflora spp. mantidas no Banco de Germoplasma “Flor da Paixão”, situado no Distrito Federal. Neste estudo usamos e combinamos várias ferramentas e metodologias a fim de caracterizar os vírus presentes nestas plantas. Isto inclui, tecnologia de sequenciamento de alto rendimento (do inglês, HighThroughput Sequencing- HTS), ferramentas de bioinformática, RT-PCR, PCR, clonagem molecular, RACE (do inglês, 5'- and 3'-rapid amplification of cDNA ends), hibridização de ácidos nucleicos por Southern blot, e sequenciamento de Sanger. Nossos resultados identificaram a ocorrência inédita de vários vírus (prováveis novas espécies, e vírus descritos em outras culturas) infectando diferentes espécies cultivadas e não cultivadas de passiflora. Nossos achados incluem o cowpea aphid-borne mosaic virus (CABMV, gênero Potyvirus, família Potyviridae), lettuce chlorosis virus (LCV, gênero Crinivirus, família Bromoviridae), cowpea mild mottle virus (CPMMV, gênero Carlavirus, família Betaflexiviridae), bean associated cytorhabdovirus (BaCV, espécie Cytorhabdovirus caricae, gênero Cytorhabdovirus, família Rhabdoviridae), curcubit aphid-borne yellow virus (CABYV, gênero Polerovirus, família Solemoviridae), e candidatos a novas espécies na família Rhabdoviridae. Esses vírus foram identificados em sua grande maioria em infecção mista com pelo menos um vírus, principalmente com o CABMV, que é o principal vírus que afeta a cultura no Brasil. Nossos dados também revelam que esses vírus não estão restritos apenas a uma região/estado. Ainda caracterizamos isolados CABYV de maracujazeiros, comparando-os com cepas da mesma espécie, o que revelou um complexo de dez distintos vírus que foram caracterizados anteriormente como pertencentes a mesma espécie. Nossos resultados expandem a diversidade viral conhecida em maracujazeiros do Brasil e no mundo. Estas informações serão extremamente úteis para entender a epidemiologia destes vírus no país, para o desenvolvimento de estratégias de controle mais eficazes dessas viroses, e ainda servirão como suporte em programas de melhoramento genético envolvendo a cultura.